En un mundo devastado por la bomba, Nueva York se ha transformado en un campo de batalla caótico. Las Tortugas Ninja, lideradas por Leonardo, luchan incansablemente contra las fuerzas del mal. Raphael se embarca en misiones solitarias, enfrentando la desolación con su temperamento ardiente.Donatello, el ingeniero maestro, busca soluciones tecnológicas para reconstruir la civilización, mientras que Michelangelo, el corazón del grupo, busca formas de devolver la esperanza a los sobrevivientes.April y Casey, como una pareja inseparable, lideran a los grupos de resistencia humana, enfrentándose al caos con valentía. Mientras tanto, Karai y Splinter, aunque en lados opuestos, buscan restaurar el equilibrio y la paz.El Destructor, con sus ambiciones despiadadas, se enfrenta a la Garra de Tigre, una misteriosa facción que emerge en las sombras. Mona Lisa, unida a la causa de las Tortugas, se convierte en una estratega clave en la guerra.En "Después de la Oscuridad", la lealtad se pone a prueba, las alianzas cambian, y el destino de la humanidad pende de un hilo.